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1 클로닝이란? 1
1.1  클로닝의 정의 2
1.2  새로운 유전자의 발굴 3
1.3  과거의 클로닝 5
1.4  현재의 클로닝 6

2 클로닝을 위한 준비 9
2.1  클로닝 설계에 유용한 소프트웨어 10
2.2  벡터, 플라스미드, 컨스트럭트 & 코작 염기서열(Kozak consensus sequence) 13
2.3  MCS(Multiple Cloning Site) 18
2.4  제한효소(Restriction Enzyme, RE)와 스타활성(star activity) 22
2.5  아가로즈 젤 전기영동을 이용한 DNA 분석 29
2.6  LB(Luria-Bertani) 플레이트 만들기 34
2.7  Competent Cell 37
2.8  DNA의 질량을 mole 수로 바꾸는 법 41
2.9  새로운 플라스미드를 받았을 때 42
2.10  cDNA 라이브러리 44

3 클로닝 첫걸음 47
3.1  Cut & Paste 48
3.2  DNA 염기서열분석 & direct 염기서열분석 61
3.3  클로닝을 위한 PCR & nested PCR 65
3.4  Fill-in(Full & Partial) 77
3.5  상보적인 점착말단(Compatible Cohesive End) 83
3.6  메틸화(Methylation) 85
3.7  세 절편 연결(Three-piece ligation) 93
3.8  위치지정 돌연변이(Site-directed mutagenesis) 96
3.9  TA 클로닝 & T-벡터의 제작 102
3.10  TOPO TA 클로닝 108
3.11  Gateway 클로닝 110
3.12  식물 형질전환(Plant transformation) 벡터의 구조 114
3.13  Rhizobium radiobacter 형질전환 117

4 클로닝 다음 걸음 119
4.1  유전자 중간 부분에 다른 DNA를 삽입(insertion)하는 방법 120
4.2  유전자 중간 부분을 삭제(deletion)하는 방법 124
4.3  유전자에 에피톱 택을 삽입하는 방법 & CRISPR/Cas9 126
4.4  번역융합(Translational Fusion) vs 전사융합(Transcriptional Fusion) 133

5 클로닝으로 인한 두통을 덜어주는 방법 135
5.1  Golden gate assembly & Golden gate를 이용해 푸는 직소퍼즐 136
5.2  In-Fusion SLIC(In-Fusion Sequence-and Ligation-Independent Cloning) 142
5.3 ‌ T4 DNA Pol SLIC
(T4 DNA Polymerase Sequence-and Ligation-Independent Cloning) 153
5.4  RE-free SLIC 159
5.5  EMP(Exponential Megapriming PCR) 클로닝 161
5.6  MRF(Modified Restriction Free) 클로닝 165
5.7  Non-template PCR 클로닝 168
5.8  cDNA 합성 의뢰 171

6 클로닝 마지막 걸음 173
6.1  다른 종에서 유사한 유전자(homolog)를 클로닝하는 방법 174
6.2  RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends) 178
6.3  BAC 재조합 181
6.4  Old Trick: 부분절단 185
6.5  벡터의 변경 187
6.6  클로닝이 다 됐다고 생각했는데 틀이동 돌연변이가 있을 때 191
6.7  클로닝의 실제: 억세게 운이 없는 경우 193

7 클로너에게 주는 조언 205
7.1  클로닝이 안 될 때 206
7.2  클로닝의 정리와 기록 209

심화학습을 위한 문헌 213
약자 215
찾아보기 217